1915年，月霞在海潮寺创办华严大学，开启近代杭州佛教教育事业的先声。其后三十余年间，先后出现了僧师范讲习所（昭庆寺）、天台宗佛学院（梵天寺）、性宗佛学院（圣水寺）、中国佛教律学院（海会寺）、武林佛学院（灵峰寺）。其中，由太虚大师大力支持，若瓢、巨赞等于灵峰寺（今杭州植物园）创办的武林佛学院在杭州佛教教育史上具有举足轻重的作用，并最终发展成今天国内唯一以佛教艺术为特色的杭州佛学院。

1946年4月，杭州佛教界在画僧若瓢的呼吁下，开始着手创办杭州武林佛学院。学院采用公司制，以若瓢为董事长，杭州各大寺庙住持共同组成董事会，聘请佛学院院长主持教务工作。当年8月8日开学，招收学僧三十人。此举得到了太虚大师的大力支持，当即派弟子会觉前来任院长，随即又派出演培（任教务主任）、妙钦、仁俊等弟子前来襄助。

1948年秋，院长会觉因病请辞，董事会改聘灵隐寺巨赞继任院长。1949年1月，巨赞转道香港去了北京，武林佛学院停办。武林佛学院创办以来，迅速成为当时浙江地区影响最大的佛学院，先后有会觉、巨赞、演培、妙钦、仁俊、续明、方兴、印顺、照喜、月池等高僧大的前来校执教。

1998年，经光泉法师提议，杭州市佛教协会批准，在中天竺法净禅寺“杭州佛教僧伽进修班”。2001年，启用“杭州佛学院（筹）”。2006年春，经过近八年时间发展，“杭州佛教僧伽进修班”获得国家宗教局批准正式更名为“杭州佛学院”。2010年，法云新校区落成，成立佛教艺术院。2013年，在法镜寺成立女众部外语院。杭州佛学院自1998年成立以来，已向全国培养合格僧才约350余名，现有就读学生约140名，其中教理院90人，艺术院40人，外语院14人，海外留学生6人。